Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc13D3YV10 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms