Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930444P10RikD3YUR1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms