Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2d4D3YUH6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d4D3YUH6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms