Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol6B7ZC55 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms