Protein–RNA interactions for Protein: B2RV46

Spata6l, Spermatogenesis associated 6-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6lB2RV46 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spata6lB2RV46 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spata6lB2RV46 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms