Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms