Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms