Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms