Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms