Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfx1B1AY10 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfx1B1AY10 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms