Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm438B1ASB3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms