Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r232A2RTT5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r232A2RTT5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms