Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Frmpd1A2AKB4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Frmpd1A2AKB4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms