Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930447F04RikA2AFR2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms