Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms