Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsg1A2A825 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsg1A2A825 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms