Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf19bA2A7Q9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf19bA2A7Q9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Rnf19bA2A7Q9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Rnf19bA2A7Q9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Rnf19bA2A7Q9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Rnf19bA2A7Q9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Rnf19bA2A7Q9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf19bA2A7Q9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Rnf19bA2A7Q9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Rnf19bA2A7Q9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf19bA2A7Q9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf19bA2A7Q9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Rnf19bA2A7Q9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf19bA2A7Q9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf19bA2A7Q9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf19bA2A7Q9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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