Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms