Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4921501E09RikA0A0R4J054 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921501E09RikA0A0R4J054 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms