Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5114W4VSN8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms