Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms