Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd1Q9Z2E2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd1Q9Z2E2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms