Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd2Q9Z2E1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms