Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mbd3Q9Z2D8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms