Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms