Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms