Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmg20bQ9Z104 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms