Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms