Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnurfQ9WU12 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnurfQ9WU12 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.8 ms