Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkraQ9WTX2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms