Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms