Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms