Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Copg1Q9QZE5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms