Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt3Q9QZ47 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt3Q9QZ47 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt3Q9QZ47 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt3Q9QZ47 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt3Q9QZ47 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt3Q9QZ47 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt3Q9QZ47 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnnt3Q9QZ47 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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