Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms