Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga2bQ9QUM0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms