Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dnaja4Q9JMC3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms