Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rabgef1Q9JM13 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Rabgef1Q9JM13 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Rabgef1Q9JM13 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Rabgef1Q9JM13 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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