Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx6Q9JKK1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms