Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msgn1Q9JK54 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms