Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rcl1Q9JJT0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcl1Q9JJT0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms