Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms