Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms