Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms