Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap3s1Q9DCR2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms