Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eif3fQ9DCH4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3fQ9DCH4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms