Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp5oQ9DB20 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5oQ9DB20 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms