Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo2Q9D8S4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms