Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl4Q9D8E6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl4Q9D8E6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms