Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fip1l1Q9D824 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fip1l1Q9D824 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fip1l1Q9D824 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms